Je předurčena především k provádění záchranných a dalších likvidačních prací, komplexnímu provádění dekontaminace osob, techniky, materiálu a terénu, sběru a likvidaci uhynulých živočichů působením virů (např. vir H5N1 – „Ptačí chřipka“), včetně následné dekontaminace budov s chovy drůbeže.

V organizační struktuře čety chemické ochrany jsou tyto jednotky:

• 1. družstvo dekontaminace osob
• 1. družstvo dekontaminace techniky
• 1. družstvo dozimetrické a chemické kontroly
• 2. družstvo dekontaminace osob
• 2. družstvo dekontaminace techniky
• 2. družstvo dozimetrické a chemické kontroly
• Družstvo radiačního, chemického a biologického průzkumu